Учёные помогут защитить сельскохозяйственные культуры от вредоносных грибов

Учёные помогут защитить сельскохозяйственные культуры от вредоносных грибов

Источник: Агровестник

Группа исследователей Санкт-Петербургского политехнического университета Петра Великого, Санкт-Петербургского государственного университета и Федерального научного центра лубяных культур впервые в мире расшифровала геном гриба Fusarium oxysporum f.sp.lini, сообщила "АгроВестнику" пресс-служба СПбПУ .

Этот паразит атакует лён, а также является близким родственником гриба, вызывающего «панамскую болезнь» у бананов, которая за последние 70 лет полностью уничтожила несколько сортов. Новые данные помогут понять, как защитить лён от «бананового» сценария, а в перспективе – избавить от вредоносного гриба и другие сельскохозяйственные культуры. Результаты исследования опубликованы в журнале Molecular Plant-Microbe Interactions.

Фузариоз – заболевание растений, с которым хорошо знаком любой фермер: различные виды грибов из рода Fusarium, а известно их больше 120, способны поражать томаты, огурцы, дыню, капусту, горох, кукурузу, ячмень, пшеницу и множество других культур. Одна из самых известных проблем, которую вызывают эти паразиты, называется «панамская болезнь»: с её вспышками на банановых плантациях люди борются ещё с 1950-х годов. В редких случаях представители рода Fusarium могут даже атаковать человека, если у него заметно ослаблен иммунитет. Кроме того, эти грибы массово поражают лён – главную текстильную и одну из важнейших масличных культур России.

«К сожалению, поливать химикатами заражённое растение практически бесполезно, потому что гриб живёт внутри него и в почве, а его споры могут сохраняться очень долго. Мировое сообщество считает, что правильный подход – это выведение устойчивых сортов, – рассказала профессор Центра геномной биоинформатики имени Ф. Г. Добржанского СПбГУ Анастасия Самсонова. – Эволюция не стоит на месте, и между паразитом и хозяином постоянно происходит генетическая “гонка вооружений”: в определённый момент сорта, которые сегодня используются в промышленности, могут перестать быть устойчивыми, и их станет невыгодно выращивать. Поэтому неизбежно возникнет спрос на новые сорта, которые к этому моменту уже должны быть выведены».

Вот почему, объясняют учёные СПбГУ, важно изучать гены сельскохозяйственных растений, а также их вредителей. Вместе с коллегами из СПбПУ (лаборатория математической биологии и биоинформатики) и Федерального научного центра лубяных культур (лаборатория селекционных технологий под руководством Т.А. Рожминой) они впервые смогли расшифровать геном гриба Fusarium oxysporum f.sp. lini, который является причиной самой распространённой болезни льна – фузариозной гнили. Более того, подчёркивают биоинформатики, геном, включающий около 14 тысяч генов, удалось собрать по хромосомам – это необходимо для дальнейших исследований в контексте эволюции.

Мария Самсонова, заведующая лабораторией «Математическая биология и биоинформатика» Санкт-Петербургского политехнического университета, отмечает: «Использование современных омиксных технологий в сочетании с биоинформатикой позволит пролить свет на механизмы взаимодействия патогена с растением и, благодаря этому, сократить время получения устойчивых сортов».

«В геноме этого гриба есть две части: одна – более-менее постоянная и стабильная, практически одинаковая у разных видов рода Fusarium, другая – меняется от гриба к грибу: например, у вредителей банана она одна, у вредителей помидоров – другая, – рассказал профессор Центра геномной биоинформатики имени Ф. Г. Добржанского СПбГУ Александр Канапин. – Тот факт, что мы смогли собрать хромосомы, – это очень большой шаг вперёд с точки зрения понимания его эволюции и приспособления к конкретному хозяину».

Следующий шаг исследователей – сравнить геном льняного паразита с известными геномами паразитических грибов из этого же рода, но поражающих другие растения. Учёные попытаются найти генетическую причину того, почему одному штамму больше «нравится» атаковать дыни, а другому – помидоры. Это позволит выяснить конкретные биохимические механизмы адаптации паразита и, что самое важное, найти гены, которые за них отвечают. Если это удастся, то с помощью технологий редактирования генома можно будет создать новый сорт льна, устойчивый к фузариозу.

По мнению Марии Самсоновой, другим важным направлением, является изучение коллекции устойчивых и восприимчивых сортов льна Центра лубяных культур. Фузариоз – это системное заболевание, включающее быстрый ответ растения на инфекцию и без детального понимания механизмов такого ответа паразит всегда будет опережать селекционеров в «гонке вооружений».

«Методы, которые мы сегодня развиваем и совершенствуем в процессе работы с грибами, могут быть использованы и для других аналогичных проектов, связанных с растениями, – рассказал Александр Канапин. – Аналогичным образом мы можем проанализировать паразитов, к примеру, пшеницы или томатов и понять, как лучше выводить устойчивые сорта. Главная идея нашего центра геномной биоинформатики – разрабатывать аналитические и инфраструктурные решения, которые будут использоваться снова и снова для реализации не только фундаментальных, но и практических задач».

«Методы, которые мы сегодня развиваем и совершенствуем в процессе работы с грибами, могут быть использованы и для других аналогичных проектов, связанных с растениями, – рассказал Александр Канапин. – Аналогичным образом мы можем проанализировать паразитов, к примеру, пшеницы или томатов и понять, как лучше выводить устойчивые сорта. Главная идея нашего центра – предлагать решения, которые будут использоваться снова и снова для реализации не только фундаментальных, но и практических задач».

Исследование поддержано грантом Российского научного фонда № 19-16-00030, а также из средств государственного задания СПбГУ (проект номер 51148284).

Реклама

Возможно, вам это будет интересно